Este conjunto de datos muestra la participación en la defensa antioxidante, de las dos ferredoxina/flavodoxina NADPH oxidorreductasas de bacterias FPRs y del transportador de electrones flavodoxinaver3 fldver3. Los mismos fueron recolectados tras realizar una caracterización cinético-estructural, y su expresión frente a agentes prooxidantes y radiación UV. Las técnicas utilizadas incluyeron: espectroscopía uv-visible, de fluorescencia; geles de proteínas nativos, SDS-PAGE (electroforesis en gel de poliacrilamida con dodecilsulfato sódico) , western blot, qRTPCR (reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa en tiempo real).
El microorganismo de estudio proviene de un aislamiento de la Laguna Verde ubicada en la Puna Argentina, al cual denominamos Acinetobacter sp. Ver3 (Ver3). A partir del análisis de secuencia genómica de este poliextremófilo altoandino, Ver3, se encontraron dos FPR putativas, designadas como FPR1ver3 y FPR2ver3, y clasificadas estructuralmente como subclase bacteriana 1 y 2. Presenta, además, una posible flavodoxina designada como flavodoxinaver3 (fldver3), la cual podría funcionar como par redox de una o ambas FPRs.
Reutilización de los datos:
Los aislamientos microbianos de ecosistemas escondidos en lo alto y remoto de los Andes, tienen gran importancia como modelos extremófilos, a partir de los cuales se pueden estudiar mecanismos moleculares novedosos. Estos pueden involucrar, por ejemplo, enzimas reparadoras de ADN y bombas de flujo de arsénico para las cuales se contemplan aplicaciones médicas y de biorremediación, respectivamente. En particular, este conjunto de datos podrá permitir la comparación con otras reductasas bacterianas ya descriptas de organismos modelos. (2023-09-06)
English Description:
This data set shows the participation in antioxidant defense of the two FPRs and the electron transporter fldver3. They were collected after carrying out a kinetic-structural characterization, and their expression against pro-oxidant agents and UV radiation. The techniques used included: UV-visible, fluorescence spectroscopy; native protein gels, SDS-PAGE, western blot, qRTPCR.
The study microorganism comes from an isolation from Laguna Verde located in the Argentine Puna, which we call Acinetobacter sp. Ver3 (Ver3). From the genomic sequence analysis of this high Andean polyextremophile, Ver3, two putative FPRs were found, designated as FPR1ver3 and FPR2ver3, and structurally classified as bacterial subclass 1 and 2. It also presents a possible flavodoxin designated as flavodoxinver3 (fldver3), which could function as a redox couple of one or both FPRs.
Value of the data:
Microbial isolates from ecosystems hidden high and remote in the Andes are of great importance as Extremophile models, from which novel molecular mechanisms can be studied. These may involve, for example, DNA repair enzymes and arsenic efflux pumps for which medical and bioremediation applications are envisioned, respectively. In particular, this data set may allow comparison with other bacterial reductases already described from very model organisms. (2023-09-06) |
