Introduction
Chagas disease, caused by Trypanosoma cruzi, is a major health problem in Latin America and an emerging concern worldwide. Experimental models are essential to study host–parasite interactions and disease progression. This dataset provides experimental data from BALB/c mice infected with T. cruzi strain Dm28c (DTU TcI), representing a low-virulence, non-lethal infection model. The study was designed to follow the course of infection over time, with analyses performed at 0, 7, 10, 14, 21, and 56 days post-infection (dpi).
Abbreviations
- dpi – days post-infection
- DTU – Discrete Typing Unit
- RT-qPCR – Reverse Transcription followed by Quantitative Polymerase Chain Reaction
- IFN-γ – Interferon gamma
- IL-10 – Interleukin-10 / human cytokine synthesis inhibitory factor
- IL-1β – Interleukin-1 beta
- TGF-β – Transforming growth factor beta
- TNF-α – Tumor necrosis factor alpha
Dataset content and organization
The dataset is organized into three main folders according to the organ analyzed. Each folder contains subfolders corresponding to specific sample types.
1. Blood_parasitemia
Content: Parasitemia – counts of T. cruzi trypomastigotes in blood presented in a tab-delimited table obtained by direct microscopic examination of fresh blood at multiple time points (0, 7, 10, 14, 21, and 56 dpi).
2. Heart_tissue
Content: Histological images were acquired at multiple time points (7, 10, 14, 21, and 56 dpi), including uninfected controls.
- Inflammatory_infiltrates_Dm28c_BALBc – Histological images of cardiac tissue stained with hematoxylin and eosin to visualize inflammatory infiltrates.
- Amastigote_nest_Dm28c_BALBc – Hematoxylin and eosin-stained images showing amastigote nests in cardiac tissue.
- Cardiac_fibrosis_Dm28c_BALBc – Histological images of cardiac tissue stained with Picrosirius Red/Fast Green to assess fibrosis.
3. Spleen
Content: Spleen weight measurements and cytokine expression data.
- Spleen_Weight_Dm28c_BALBc – Spleen weight measurements presented in a tab-delimited table.
- RTqPCR_Spleen_Cytokine_data_Dm28c_BALBc – Cytokine expression data by RT-qPCR, including two tables: raw Ct values and ∆∆Ct processed data, relative to RPLP0, at all time points (7, 10, 14, 21, and 56 dpi), including uninfected controls. Genes analyzed: IFN-γ, IL-10, IL-1β, TNF-α, and TGF-β.
Methodology
The experimental procedures used to generate this dataset, including mouse infection, sample collection, parasitemia counts, histological analyses, and RT-qPCR, are detailed in the README_Dm28c_BALBc.txt file included in the repository.
Quality control
All experiments included 3–6 biological replicates per experimental group (7, 10, 14, 21 and 56 dpi), including uninfected controls, which served as reference for all comparisons. Parasitemia counts were obtained by direct microscopic examination of multiple fields per sample to minimize observer bias. For RT-qPCR, RNA integrity was verified prior to cDNA synthesis, and samples were treated with DNase to remove genomic DNA contamination. Negative controls (no template and no reverse transcriptase) were included in all runs, and Ct values were checked for consistency among replicates. Histological analyses were performed on multiple tissue sections per animal, with blinded evaluation of inflammatory infiltrates, amastigote nests, and fibrosis. Standardized staining protocols and calibrated microscopy were applied for all imaging.
Value of the data
This dataset provides raw data from a low-virulence murine model of T. cruzi infection (Dm28c strain in BALB/c mice), enabling the study of the course of infection from 0 to 56 dpi. It is useful for investigating host–parasite interactions, immune responses, and cardiac pathology under mild, non-lethal infection conditions in this particular murine model. Data include parasitemia counts, histological images, and cytokine expression by RT-qPCR, with uninfected control mice serving as a reference for all comparisons. This model allows comparative analyses with more virulent strains or different mouse backgrounds and provides a platform for evaluating diagnostic, therapeutic, and preventive strategies under low-virulence conditions. Additionally, it serves as a baseline for comparison with studies using transfected Dm28c strains available in our laboratory to investigate potential therapeutic targets. (2025-07-10)
Introducción
La enfermedad de Chagas, causada por Trypanosoma cruzi, constituye un importante problema de salud en América Latina y una preocupación emergente a nivel mundial. Los modelos experimentales son esenciales para estudiar las interacciones hospedador–parásito y la progresión de la enfermedad. Este dataset proporciona datos experimentales obtenidos de ratones BALB/c infectados con la cepa Dm28c de T. cruzi (DTU TcI), que representa un modelo de infección de baja virulencia y no letal. Con el fin de seguir el curso de la infección a lo largo del tiempo, las determinaciones fueron realizadas en distintos días postinfección (dpi): 0, 7, 10, 14, 21 y 56.
Abreviaciones
dpi – días post-infección
DTU – Unidad Discreta de Tipificación
RT-qPCR – Transcripción inversa seguida de reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa
IFN-γ – Interferón gamma
IL-10 – Interleucina-10 / factor inhibitorio de la síntesis de citoquinas humanas
IL-1β – Interleucina-1 beta
TGF-β – Factor de crecimiento transformante beta
TNF-α – Factor de necrosis tumoral alfa
Contenido y organización del dataset
El dataset se organiza en tres carpetas principales según el órgano analizado. Cada carpeta contiene subcarpetas correspondientes a tipos de muestras específicos.
1. Blood_parasitemia
Contenido: Parasitemia – recuento de tripomastigotes de T. cruzi en sangre - presentado en una tabla delimitada por tabulaciones, obtenido mediante examen microscópico directo de sangre fresca en cada punto temporal (0, 7, 10, 14, 21 y 56 dpi).
2. Heart_tissue
Contenido: Imágenes histológicas adquiridas en múltiples puntos temporales (7, 10, 14, 21 y 56 dpi), incluyendo controles no infectados.
- Inflammatory_infiltrates_Dm28c_BALBc – Imágenes histológicas de tejido cardíaco teñido con hematoxilina y eosina para visualizar infiltrados inflamatorios.
- Amastigote_nest_Dm28c_BALBc – Imágenes teñidas con hematoxilina y eosina que muestran nidos de amastigotes en tejido cardíaco.
- Cardiac_fibrosis_Dm28c_BALBc – Imágenes histológicas de tejido cardíaco teñido con Picrosirius Red/Fast Green para evaluar fibrosis.
3. Spleen
Contenido: Mediciones de peso del bazo y datos de expresión de citoquinas.
- Spleen_Weight_Dm28c_BALBc – Mediciones de peso del bazo presentadas en una tabla delimitada por tabulaciones.
- RTqPCR_Spleen_Cytokine_data_Dm28c_BALBc – Datos de expresión de citoquinas por RT-qPCR, incluyendo dos tablas: valores de Ct crudos y datos procesados ∆∆Ct, relativos a RPLP0, en todos los puntos temporales (7, 10, 14, 21 y 56 dpi), incluyendo controles no infectados. Genes analizados: IFN-γ, IL-10, IL-1β, TNF-α y TGF-β.
Metodología
Los procedimientos experimentales utilizados para generar este dataset, incluyendo infección de ratones, toma de muestras, recuentos de parasitemia, análisis histológicos y RT-qPCR, están detallados en el archivo README_Dm28c_BALBc.txt incluido en el repositorio.
Control de calidad
Todos los experimentos incluyeron 3–6 réplicas biológicas por grupo experimental (7, 10, 14, 21 y 56 dpi), incluyendo controles no infectados que se utilizaron como referencia para todas las comparaciones. Los recuentos de parasitemia se obtuvieron mediante examen microscópico directo de múltiples campos por muestra para minimizar el sesgo del observador. Para RT-qPCR, se verificó la integridad del ARN antes de la síntesis de ADNc, y las muestras fueron tratadas con DNasa para eliminar contaminación de ADN genómico. Se incluyeron controles negativos (sin templado y sin retrotranscripción) en todas las corridas, y se revisaron los valores de Ct para verificar consistencia entre réplicas. Los análisis histológicos se realizaron en múltiples cortes por animal, con evaluación ciega de infiltrados inflamatorios, nidos de amastigotes y fibrosis. Se aplicaron protocolos de tinción estandarizados y microscopía calibrada para todas las imágenes.
Valor de los datos
Este dataset proporciona datos crudos de un modelo murino de baja virulencia de infección por T. cruzi (cepa Dm28c en ratones BALB/c), permitiendo el estudio del curso de la infección desde 0 hasta 56 dpi. Es útil para investigar interacciones hospedador–parásito, respuestas inmunes y patología cardíaca bajo condiciones de infección no letales en este modelo murino particular. Los datos incluyen recuentos de parasitemia, imágenes histológicas y expresión de citoquinas por RT-qPCR, con ratones control no infectados como referencia para todas las comparaciones. Este modelo permite análisis comparativos con cepas más virulentas o diferentes antecedentes genéticos de ratones y proporciona una plataforma para evaluar estrategias diagnósticas, terapéuticas y preventivas en condiciones de baja virulencia. Además, sirve como base de comparación para estudios con cepas transfectantes de Dm28c disponibles en nuestro laboratorio para investigar posibles blancos terapéuticos. (2025-07-10) |